Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COBLL1Q53SF7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COBLL1Q53SF7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms