Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC2HC1CQ53FD0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC2HC1CQ53FD0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms