Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN2Q52LD8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RFTN2Q52LD8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms