Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC38Q502W7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms