Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms