Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CERKLQ49MI3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CERKLQ49MI3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms