Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC153Q494R4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms