Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A52Q3SY17 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A52Q3SY17 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC25A52Q3SY17 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A52Q3SY17 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A52Q3SY17 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A52Q3SY17 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms