Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL40Q2TBA0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL40Q2TBA0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL40Q2TBA0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms