Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM1Q2NKQ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM1Q2NKQ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms