Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDR2Q16832 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDR2Q16832 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
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