Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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