Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYPL1Q16563 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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