Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL23Q16540 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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