Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F4Q16254 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F4Q16254 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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