Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZFHX3Q15911 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms