Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA6Q15825 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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