Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SF3A1Q15459 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3A1Q15459 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A1Q15459 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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