Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUM3Q15397 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PUM3Q15397 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUM3Q15397 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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