Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK1Q15118 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms