Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDCD1Q15116 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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