Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCOLCEQ15113 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCOLCEQ15113 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms