Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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