Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBE4AQ14139 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE4AQ14139 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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