Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1CQ14123 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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