Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COL9A2Q14055 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL9A2Q14055 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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COL9A2Q14055 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL9A2Q14055 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL9A2Q14055 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A2Q14055 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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