Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK13Q14004 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDK13Q14004 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK13Q14004 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
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