Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE7AQ13946 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PDE7AQ13946 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PDE7AQ13946 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PDE7AQ13946 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PDE7AQ13946 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PDE7AQ13946 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PDE7AQ13946 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE7AQ13946 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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