Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA4Q13772 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA4Q13772 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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