Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FHL3Q13643 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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