Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD4Q13485 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD4Q13485 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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