Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF6Q13247 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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