Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CHAF1BQ13112 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1BQ13112 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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