Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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TRAF1Q13077 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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