Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSPAN31Q12999 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSPAN31Q12999 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms