Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 DCTN2-202ENST00000543672 1321 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.035e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ST7L-224ENST00000495109 591 ntTSL 58.55□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 IBTK-202ENST00000369751 4437 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 DCTN2-219ENST00000550988 795 ntTSL 48.5□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 KDM4C-204ENST00000420847 1064 ntTSL 58.45□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C17orf62-218ENST00000579444 470 ntTSL 28.2□□□□□ -1.14e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SMARCC2-205ENST00000548130 1238 ntTSL 58.13□□□□□ -1.114e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CBFB-206ENST00000565389 846 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.115e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPS6KA1-208ENST00000488985 304 ntTSL 38.07□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 GPN2-201ENST00000374133 715 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PLEKHH1-211ENST00000559981 3670 ntTSL 1 (best)7.91□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CTSB-205ENST00000505496 540 ntTSL 47.82□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SLC30A10-204ENST00000484239 1902 ntTSL 27.63□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ABCE1-203ENST00000502803 782 ntTSL 57.62□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HBS1L-216ENST00000533274 2102 ntTSL 27.61□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 DMAP1-204ENST00000372290 396 ntTSL 57.56□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 37.54□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ST7L-217ENST00000477682 300 ntTSL 37.42□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ZNF131-207ENST00000507218 1352 ntTSL 1 (best)7.37□□□□□ -1.235e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ST7L-227ENST00000498197 472 ntTSL 37.33□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EXOC4-209ENST00000469115 755 ntTSL 37.32□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EXOC4-217ENST00000483800 559 ntTSL 47.32□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EXOC4-221ENST00000489931 578 ntTSL 47.32□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EXOC4-216ENST00000482089 628 ntTSL 47.32□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SNX1-207ENST00000559401 408 ntTSL 27.31□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDRG3-205ENST00000422536 736 ntTSL 37.08□□□□□ -1.285e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 KDM6A-205ENST00000433797 4324 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.285e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDUFAF7-209ENST00000455230 946 ntTSL 57□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 JAG1-209ENST00000622545 507 ntTSL 56.9□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EIF4G2-215ENST00000530564 849 ntTSL 26.87□□□□□ -1.315e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.335e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.355e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PLPPR1-204ENST00000463206 748 ntTSL 36.57□□□□□ -1.365e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDUFAF7-204ENST00000419278 680 ntTSL 56.42□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 QARS-219ENST00000482468 402 ntTSL 26.36□□□□□ -1.395e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 STAT6-216ENST00000555318 465 ntTSL 36.36□□□□□ -1.395e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 IBTK-205ENST00000503400 5239 ntTSL 1 (best)6.36□□□□□ -1.395e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 IBTK-204ENST00000471036 721 ntTSL 36.27□□□□□ -1.415e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 GDPD5-217ENST00000534322 527 ntTSL 36.2□□□□□ -1.425e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.425e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.435e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ATXN7-209ENST00000484668 573 ntTSL 35.97□□□□□ -1.455e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 MORC2-205ENST00000469915 595 ntTSL 35.86□□□□□ -1.475e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.485e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NREP-210ENST00000503429 1079 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.485e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 C17orf62-236ENST00000584891 468 ntTSL 35.75□□□□□ -1.494e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDUFAF7-207ENST00000439218 934 ntTSL 35.74□□□□□ -1.495e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EXOC4-212ENST00000479839 543 ntTSL 45.59□□□□□ -1.515e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NDUFAF7-212ENST00000474257 1470 ntTSL 1 (best)5.56□□□□□ -1.525e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PTPN12-214ENST00000520947 664 ntTSL 55.45□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 SMARCC2-207ENST00000549757 1062 ntTSL 55.43□□□□□ -1.544e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 BTBD3-205ENST00000422390 583 ntTSL 45.34□□□□□ -1.555e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 GPN2-205ENST00000477418 749 ntTSL 25.25□□□□□ -1.575e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 DCTN2-205ENST00000546758 817 ntTSL 55.08□□□□□ -1.65e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.65e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PSME2-210ENST00000559493 702 ntTSL 24.95□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 MAPK13-204ENST00000476951 499 ntTSL 34.93□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 STIP1-209ENST00000540736 399 ntTSL 24.92□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 KDM6A-203ENST00000414389 4189 ntTSL 54.75□□□□□ -1.655e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 CBFB-208ENST00000567947 610 ntTSL 34.69□□□□□ -1.665e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.675e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PPP6R3-216ENST00000529172 500 ntTSL 24.6□□□□□ -1.674e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PPP6R3-207ENST00000525050 513 ntTSL 34.6□□□□□ -1.674e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HBS1L-209ENST00000526100 1600 ntTSL 24.53□□□□□ -1.685e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.695e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.695e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 IBTK-203ENST00000445419 3663 ntTSL 24.43□□□□□ -1.75e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 AKTIP-210ENST00000568022 819 ntTSL 54.13□□□□□ -1.755e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 BUD31-209ENST00000496696 585 ntTSL 24.09□□□□□ -1.755e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 HBS1L-210ENST00000527005 2224 ntTSL 1 (best)4.03□□□□□ -1.765e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.785e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PPP6R3-213ENST00000527069 573 ntTSL 53.78□□□□□ -1.84e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 UBR4-215ENST00000492606 314 ntTSL 33.63□□□□□ -1.835e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ABCE1-208ENST00000509593 582 ntTSL 53.57□□□□□ -1.845e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ABCE1-210ENST00000515678 750 ntTSL 23.46□□□□□ -1.865e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PLPPR1-203ENST00000456287 472 ntTSL 33.42□□□□□ -1.865e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 PPP6R3-222ENST00000531244 687 ntTSL 53.34□□□□□ -1.874e-11■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 IBTK-207ENST00000505222 5547 ntTSL 1 (best)3.22□□□□□ -1.895e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 BUD31-207ENST00000471813 341 ntTSL 23.06□□□□□ -1.925e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 ZNF131-210ENST00000508259 501 ntTSL 52.82□□□□□ -1.965e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EIF4G2-222ENST00000532120 223 ntTSL 32.51□□□□□ -2.015e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 EIF4G2-217ENST00000531180 557 ntTSL 42.48□□□□□ -2.015e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 GPN2-204ENST00000461282 136 ntTSL 30.9□□□□□ -2.275e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0□□□□□ -2.415e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 GSAP-212ENST00000489920 562 ntTSL 47.73□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 NOC2L-204ENST00000483767 1611 ntTSL 218.14■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 39.5
SF3A3Q12874 RBM6-205ENST00000425608 1886 ntTSL 219.26■□□□□ 0.672e-11■■■■■ 39.4
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