Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TROQ12816 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TROQ12816 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TROQ12816 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TROQ12816 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TROQ12816 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TROQ12816 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TROQ12816 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TROQ12816 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TROQ12816 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TROQ12816 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TROQ12816 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TROQ12816 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TROQ12816 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TROQ12816 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TROQ12816 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TROQ12816 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TROQ12816 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TROQ12816 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TROQ12816 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TROQ12816 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TROQ12816 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TROQ12816 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TROQ12816 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TROQ12816 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TROQ12816 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TROQ12816 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TROQ12816 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TROQ12816 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
TROQ12816 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TROQ12816 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TROQ12816 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TROQ12816 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TROQ12816 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TROQ12816 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TROQ12816 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TROQ12816 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TROQ12816 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TROQ12816 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TROQ12816 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TROQ12816 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TROQ12816 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TROQ12816 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TROQ12816 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TROQ12816 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TROQ12816 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TROQ12816 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TROQ12816 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TROQ12816 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TROQ12816 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TROQ12816 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TROQ12816 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TROQ12816 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TROQ12816 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TROQ12816 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TROQ12816 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TROQ12816 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TROQ12816 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TROQ12816 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TROQ12816 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TROQ12816 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
TROQ12816 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TROQ12816 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TROQ12816 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TROQ12816 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TROQ12816 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TROQ12816 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TROQ12816 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TROQ12816 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TROQ12816 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TROQ12816 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TROQ12816 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TROQ12816 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TROQ12816 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TROQ12816 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TROQ12816 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TROQ12816 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms