Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YPL197CYPL197C 414 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ERV15YBR210W 429 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 HCA4YJL033W 2313 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ERD1YDR414C 1089 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 PET117YER058W 324 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YFL051CYFL051C 483 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 LOC1YFR001W 615 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 IES3YLR052W 753 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 PBA1YLR199C 831 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YNL019CYNL019C 855 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YNL033WYNL033W 855 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YNL109WYNL109W 546 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YOL159CYOL159C 516 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YDL109CYDL109C 1944 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 WHI2YOR043W 1461 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 NMD3YHR170W 1557 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 FET4YMR319C 1659 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 MRC1YCL061C 3291 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 COX9YDL067C 180 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 UBC8YEL012W 657 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 SMB1YER029C 591 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 THO1YER063W 657 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YPT1YFL038C 621 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 PEX4YGR133W 552 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YHR138CYHR138C 345 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YLR224WYLR224W 1110 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YLR297WYLR297W 390 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 MOH1YBL049W 417 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 TPM1YNL079C 600 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 GCY1YOR120W 939 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ERV2YPR037C 591 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 HFD1YMR110C 1599 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 VPS17YOR132W 1656 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 UTP18YJL069C 1785 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 TEL2YGR099W 2067 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 SST2YLR452C 2097 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 PMS1YNL082W 2622 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ENP2YGR145W 2124 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ALD2YMR170C 1521 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ALT1YLR089C 1779 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YPQ2YDR352W 954 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YER085CYER085C 522 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YER119C-AYER119C-A 372 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 SPT2YER161C 1002 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 FBA1YKL060C 1080 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 SRB6YBR253W 366 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 MSC3YLR219W 2187 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 AFG1YEL052W 1530 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 OSM1YJR051W 1506 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 DIA3YDL024C 1407 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 HOF1YMR032W 2010 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 DDC1YPL194W 1839 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YCL076WYCL076W 744 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 APA2YDR530C 978 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YDR535CYDR535C 501 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 SPO13YHR014W 876 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 FUN19YAL034C 1242 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 FOL3YMR113W 1284 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ERD2YBL040C 660 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 ROX1YPR065W 1107 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 NGG1YDR176W 2109 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 STR2YJR130C 1920 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 HXT4YHR092C 1731 nt5.71□□□□□ -1.49
TY1A-DR3Q12441 RRB1YMR131C 1536 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 snR5snR5 204 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 UTR5YEL035C 501 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 GEP5YLR091W 882 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 RLP7YNL002C 969 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YAF9YNL107W 681 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ZIM17YNL310C 525 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 MRPS12YNR036C 462 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 CAT5YOR125C 702 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 SDH8YBR269C 417 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 PAT1YCR077C 2391 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 MSY1YPL097W 1479 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 THI2YBR240C 1353 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 NOP56YLR197W 1515 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 PHR1YOR386W 1698 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 CLA4YNL298W 2529 nt5.7□□□□□ -1.5
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