Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YML6YML025C 861 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 AIM33YML087C 939 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 TAF9YMR236W 474 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 MRPS18YNL306W 654 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 RPL19AYBR084C-A 570 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 TRM1YDR120C 1713 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 IES1YFL013C 2079 nt7.34□□□□□ -1.23
NCR1Q12200 CAN1YEL063C 1773 nt7.33□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YDR417CYDR417C 372 nt7.33□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 GCG1YER163C 699 nt7.33□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YHR130CYHR130C 336 nt7.33□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.33□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 EOS1YNL080C 1101 nt7.33□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YNL089CYNL089C 477 nt7.33□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 DLD1YDL174C 1764 nt7.33□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 TFB2YPL122C 1542 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 TLC1TLC1 1301 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 HES1YOR237W 1305 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 TDP1YBR223C 1635 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 RPN11YFR004W 921 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YNL035CYNL035C 1170 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YNL181WYNL181W 1224 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 CUE5YOR042W 1236 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 CHK1YBR274W 1584 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 CDC16YKL022C 2523 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 BRE5YNR051C 1548 nt7.32□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 IMG1YCR046C 510 nt7.31□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 VPS61YDR136C 573 nt7.31□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YIL028WYIL028W 399 nt7.31□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YAL004WYAL004W 648 nt7.31□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YMR084WYMR084W 789 nt7.31□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YMR315WYMR315W 1050 nt7.31□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YNL109WYNL109W 546 nt7.31□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 SWT1YOR166C 1377 nt7.31□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 RIM21YNL294C 1602 nt7.3□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 PPS1YBR276C 2424 nt7.3□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 UNG1YML021C 1080 nt7.3□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YNL338WYNL338W 159 nt7.3□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 RPS9BYBR189W 588 nt7.3□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 MSN4YKL062W 1893 nt7.3□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 LYS9YNR050C 1341 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 BPL1YDL141W 2073 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 PRB1YEL060C 1908 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 CNA1YLR433C 1662 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 GRX3YDR098C 858 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 CBR1YIL043C 855 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YMR099CYMR099C 894 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 ERG2YMR202W 669 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 PDR17YNL264C 1053 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 TPK2YPL203W 1143 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YPR099CYPR099C 357 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 MRPL27YBR282W 441 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 CDC1YDR182W 1476 nt7.29□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 MAL13YGR288W 1422 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 MIP1YOR330C 3765 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YKE4YIL023C 1041 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 UPS2YLR168C 693 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YMR310CYMR310C 954 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YNL235CYNL235C 432 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 HUB1YNR032C-A 222 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 CDC33YOL139C 642 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 snR17asnR17a 333 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 CMR3YPR013C 954 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 SPN1YPR133C 1233 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 JJJ1YNL227C 1773 nt7.28□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 BIK1YCL029C 1323 nt7.27□□□□□ -1.24
NCR1Q12200 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YDR187CYDR187C 519 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 PRE9YGR135W 777 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 OTU2YHL013C 924 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 MAK16YAL025C 921 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 AIM24YJR080C 1185 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 ENT3YJR125C 1227 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YBL096CYBL096C 309 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 BRX1YOL077C 876 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YOR379CYOR379C 339 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 NGL2YMR285C 1548 nt7.27□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 OSW2YLR054C 2175 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YOR389WYOR389W 1875 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 FMN1YDR236C 657 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YER145C-AYER145C-A 438 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 RME1YGR044C 903 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YML018CYML018C 1182 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 SMA2YML066C 1110 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 BET5YML077W 480 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YPR015CYPR015C 744 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 SEN54YPL083C 1404 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 KIN3YAR018C 1308 nt7.26□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 SLA2YNL243W 2907 nt7.25□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 DAD1YDR016C 285 nt7.25□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 OM45YIL136W 1182 nt7.25□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YKL071WYKL071W 771 nt7.25□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 RAD14YMR201C 1116 nt7.25□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 TIF11YMR260C 462 nt7.25□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YNL092WYNL092W 1203 nt7.25□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 DGK1YOR311C 873 nt7.25□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 YPR202WYPR202W 717 nt7.25□□□□□ -1.25
NCR1Q12200 CDC14YFR028C 1656 nt7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37 ms