Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPSF1Q10570 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CPSF1Q10570 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPSF1Q10570 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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