Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms