Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSRP1Q08945 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms