Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOS1Q07889 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOS1Q07889 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms