Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLEQ07864 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLEQ07864 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLEQ07864 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLEQ07864 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLEQ07864 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLEQ07864 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLEQ07864 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLEQ07864 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLEQ07864 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms