Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CHRNDQ07001 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNDQ07001 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms