Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPAQ06546 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms