Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTDSPL2Q05D32 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms