Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YDR090C	YDR090C	933 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	YHB1	YGR234W	1200 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	ILV5	YLR355C	1188 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	INA17	YPL099C	549 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	SYF1	YDR416W	2580 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	KIN3	YAR018C	1308 nt		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	YIL089W	YIL089W	618 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	YML119W	YML119W	1074 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	VPS21	YOR089C	633 nt		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	AAD3	YCR107W	1092 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	MRH4	YGL064C	1686 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	YRB30	YGL164C	1323 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	YMR114C	YMR114C	1107 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	APP1	YNL094W	1764 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	MDM12	YOL009C	816 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	AIM39	YOL053W	1188 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	HRT1	YOL133W	366 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	SPS4	YOR313C	1017 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	SSU1	YPL092W	1377 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	CNS1	YBR155W	1158 nt		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	Q04048	ROD1	YOR018W	2514 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	PDR5	YOR153W	4536 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	SKG6	YHR149C	2205 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	PTR3	YFR029W	2037 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	CLB5	YPR120C	1308 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	SRO9	YCL037C	1305 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	CHL1	YPL008W	2586 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	DCV1	YFR012W	609 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YKL177W	YKL177W	339 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	MMM1	YLL006W	1281 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	REX3	YLR107W	1215 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	IBD2	YNL164C	1056 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	WRS1	YOL097C	1299 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	UBP10	YNL186W	2379 nt		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	ARO9	YHR137W	1542 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	BCP1	YDR361C	852 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YHR112C	YHR112C	1137 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	GTT1	YIR038C	705 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	GCD7	YLR291C	1146 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YBL036C	YBL036C	774 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	NCE102	YPR149W	522 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YOL153C	YOL153C	1746 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	KIC1	YHR102W	3243 nt		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	SWP82	YFL049W	1872 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	HMS1	YOR032C	1305 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	BIK1	YCL029C	1323 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YCR101C	YCR101C	549 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	MAF1	YDR005C	1188 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	IRC6	YFR043C	714 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	SRB5	YGR104C	924 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	SAY1	YGR263C	1275 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YHL034W-A	YHL034W-A	462 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	COX19	YLL018C-A	297 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	GLO4	YOR040W	858 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YER077C	YER077C	2067 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	PEX30	YLR324W	1572 nt		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	PHO84	YML123C	1764 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	HPR1	YDR138W	2259 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	NBP2	YDR162C	711 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	SLX8	YER116C	825 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	IMP2	YMR035W	534 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YMR085W	YMR085W	1299 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	OPY1	YBR129C	987 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	HO	YDL227C	1761 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	VAC7	YNL054W	3498 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	ALR2	YFL050C	2577 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	JEN1	YKL217W	1851 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YHP1	YDR451C	1062 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	MAG1	YER142C	891 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	COS12	YGL263W	1143 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	ELF1	YKL160W	438 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	GTT2	YLL060C	702 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	RAD14	YMR201C	1116 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YPR174C	YPR174C	666 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	RRN11	YML043C	1524 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	GZF3	YJL110C	1656 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	GPI13	YLL031C	3054 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	GSM1	YJL103C	1857 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	NAM2	YLR382C	2685 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	SMF1	YOL122C	1728 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YCL075W	YCL075W	441 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	GRX6	YDL010W	696 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	MSS2	YDL107W	1056 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YDR193W	YDR193W	399 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	SDT1	YGL224C	843 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	YGR219W	YGR219W	342 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	PEX21	YGR239C	867 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	ECM34	YHL043W	513 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	DCS1	YLR270W	1053 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	ASC1	YMR116C	960 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	Q04048	EMP47	YFL048C	1338 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	GLO3	YER122C	1482 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	NUS1	YDL193W	1128 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	tC(GCA)B	tC(GCA)B	72 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	tC(GCA)G	tC(GCA)G	72 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	tC(GCA)P1	tC(GCA)P1	72 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	tC(GCA)P2	tC(GCA)P2	72 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		4.52	□□□□□ -1.69

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