Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD4Q01804 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms