Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRCDQ00LT1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms